Na skórze znajduje się cienka warstewka powierzchniowa i kolonie drobnoustrojów zwanych saprofitami. Współżyją one ze skórą nie wyrządzając jej żadnej szkody; przeciwnie - stanowią część mechanizmu obronnego przeciwko infekcjom, ponieważ są trudne do usunięcia.
Propiopibacterium ac-nes, drobnoustrój, który w normalnych warunkach znajduje się na skórze, czasem jednak mnoży się i przechodzi w postać patogenną. Błony śluzowe również mają swoją florę saprofityczną; drobnoustroje Candida albicans, znajdujące się normalnie w pochwie, w wyniku nadmiernego rozmnożenia mogą spowodować białe upławy. Przyczyną infekcji skóry jest zaburzenie ekologii skórnej. Dochodzi do niego bądź z powodu nadmiernej suchości czy wilgotności, bądź też dlatego, że zaszłe na skórze zmiany wzmogły jej wrażliwość, bądź też wreszcie - w efekcie osłabienia naturalnej samoobrony organizmu (obniżenie odporności). Otoczenie jest również bardzo istotnym czynnikiem wpływającym na ekologię skóry: kontakt z nosicielem wirusa czy bakterii może wywołać infekcję. Czynnikami zewnętrznymi powodującymi choroby skóry są bakterie, grzyby, wirusy, pasożyty. Zarazki, które najczęściej spotykamy na skórze, to paciorkowiec i gronkowiec złocisty. Wywołują one takie choroby, jak liszajec i czyraki. Działają na nie antybiotyki przeciwbakteryjne. Grzybicami wywoływanymi przez różnorodne grzyby można się zarazić od zwierząt. Grzybice pojawiające się między palcami nóg, częste u sportowców (athlete's foot) są często wynikiem przepocenia i maceracji skóry, spowodowanych chodzeniem w butach sportowych. Grzybice leczy się zazwyczaj maściami przeciwgrzybicznymi. Czasem potrzebne są także lekarstwa stosowane ogólnie (antybiotyki przeciwgrzy-biczne). Wirusy wywołują większość dziecięcych chorób zakaźnych (świnka, różyczka, ospa wietrzna). O ile nie ma powikłań, choroby te leczą się samorzutnie; leczenie polega głównie na prewencji, czyli szczepieniach. Wirusy mogą być także przyczyną wielu chorób skórnych, takich jak opryszczka, półpasiec. Pasożyty (wszy, świerzb) przenoszą się wyłącznie przez kontakt osobisty. Leczy się je środkami owadobójczymi stosowanymi miejscowo na skórę.Zdarza się jednak, że saprofity przysparzają problemów.
Przybierają wówczas postać patogenną, a niezwykle bujny ich rozrost bywa przyczyną wielu schorzeń.